影片的故事以奥运会上11名以色列运动员被巴勒斯坦武装人员屠杀的惨案事件为背景，展开情节。而注意力主要放在了以色列的复仇行动上。影片中，身为“摩萨德”人的艾瑞克·巴纳负责追踪那伙来自巴勒斯坦地区的名为“黑色九月”的恐怖分子。同时，以色列方面为了对巴勒斯坦人还以颜色，也随即派出了杀手对付巴勒斯坦人。本该是万众欢腾的慕尼黑却被重重的阴森恐怖所笼罩。这过程中，以色列的杀手们也开始不理解他们暗杀目标的选定方式，也不明白手中黑名单上的人从何而来，他们所要做的就是不惜一切代价干掉名单上的所有人。随着整个事情的发展，情况越来越负责起来，杀手们开始怀疑自己的所作所为是否正确。此时，人性的力量在每一位杀手心中起了作用。一面是上级的命令，国家的需要，自己的使命，金钱的趋势；令一面是面带笑容的亲人，同样流淌着鲜血的“敌人”……抉择、痛苦、恐惧、疑虑……重重复杂的内心与外患纠缠着几个“摩萨德人”。然而，血腥的杀戮才刚刚开始……